Questions and Answers

0 Like 0 Dislike

Anonymous

undefined method 'include?' error

I keep getting this error, and I have tried running many different simulations.

Error: undefined method 'include?' 

Command file:

#LAMMPS Input file generated by Avogadro

# simv1_input

 

# Intialization

units real

dimension 3d

boundary p p p

atom_style molecular

 

# Atom Definition

read_data v2

replicate 1 1 1

 

 

# Settings

velocity all create 70.00 4928459 rot yes mom yes dist gaussian

fix ensemble all nvt temp 70.00 70.00 100 tchain 1

 

timestep 2.0

 

# Output

dump dumpXYZ all xyz 1 simv1.txt

thermo_style one

thermo 50

 

# Run the simulation

run 50

 

Data file: 

36

O          2.60641        0.00000        0.46000
O          5.21359        0.00000        6.90000
H          2.60641        0.00000        1.28064
H          3.42516        0.00000        0.19136
H          5.62649        0.71109        7.17600
O         -1.30320        2.25721        0.46000
O          2.60680        4.51510        0.46000
O          5.21359        0.00000        4.14000
O         -2.60680        4.51510        4.14000
O          1.30320        2.25721        4.14000
O         -2.60680        4.51510        6.90000
O          1.30320        2.25721        6.90000
O          2.60641        0.00000        3.22000
O         -1.30320        2.25721        3.22000
O          2.60680        4.51510        3.22000
H         -1.30320        2.25721        1.28064
H          2.60680        4.51510        1.28064
H          5.21359        0.00000        4.96064
H         -2.60680        4.51510        4.96064
H          1.30320        2.25721        4.96064
H         -1.71258        2.96628        0.19136
H          2.19742        3.80604        0.19136
H          4.39484        0.00000        3.87136
H         -2.19742        3.80604        3.87136
H          1.71258        2.96628        3.87136
H          4.39093        4.51714        7.17600
H          1.71258        1.54409        7.17600
H         -1.71649        6.06123        3.49600
H         -0.48093        2.25518        3.49600
H          2.19742        5.22823        3.49600
H          6.10742        1.54409        3.49600
H          2.19351        0.71109        3.49600
H          3.42907        4.51714        3.49600
H         -2.19742        5.22823        7.17600
H          1.71649        6.06123        7.17600
H          0.48093        2.25518        7.17600

Report abuse

0 Responses

No other responses made.